Gastroenteroloji’de endoskopi, tanı ve tedavi amacıyla sindirim kanalının görüntülenmesi işlemidir. Üst sindirim kanalının endoskopisi esnasında gırtlak, yemek borusu, gastroözofajiyal bileşke, midenin kısımları, pilorik kanal, ve on iki parmak bağırsağının kısımları görüntülenir.